コンピューターシステムの利用 / How to use of computer systems
https://www.gen-info.osaka-u.ac.jp/
ゲノム解析室 / About NGS core facility
https://www.ngs.gen-info.osaka-u.ac.jp/
OUBICバイオインフォマティクス講習会 / OUBIC Bioinformatics Training Workshop
https://oubic.biken.osaka-u.ac.jp/support/workshop/
- 多重配列アラインメントプログラムMAFFT
MAFFT is a program for multiple alignment of biological sequences
加藤和貴准教授はたんぱく質の構造やDNAの配列を解析するソフトウエアを開発。
関連記事 KYODO NEWS - フラグメント分子軌道(FMO)法によるタンパク質の量子化学計算データベース「FMODB」
Database for quantum chemical calculations of proteins using fragment molecular orbital (FMO) method
FMODBでは、FMO法によるタンパク質等の量子化学計算結果を公開している。
FMO計算から得られる残基単位の定量的な相互作用エネルギーについて、
web上での簡易解析および専用可視化プログラムBioStation Viewerを用いた詳細解析が可能。
FMO database
BioStation Viewer
関連情報 FMO創薬コンソーシアム
- シングルセルデータを生物機能の空間で解析するsoftware「ASURAT」
ASURAT for analyzing single-cell data in the space of biological functions
１細胞トランスクリプトームや空間トランスクリプトームを「生物機能の空間」で機能別に分類するツール。
これまで以上に分類性能が高く、かつ説得力のある解釈を出力する。
現在、ASURATの後継として、さらに強力な分類器を開発中。
関連記事 大阪大学研究専用ポータルサイトResOU