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  • OUBIC Bioinformatics Center Research Institute for Microbial Diseases Osaka University

Support 支援

コンピューターシステムの利用 / How to use of computer systems

https://www.gen-info.osaka-u.ac.jp/


ゲノム解析室 / About NGS core facility

https://www.ngs.gen-info.osaka-u.ac.jp/


Tools  メンバーによるソフトウェア開発 / Software Development

  • フラグメント分子軌道(FMO)法によるタンパク質の量子化学計算データベース「FMODB
    Database for quantum chemical calculations of proteins using fragment molecular orbital (FMO) method
    FMODBでは、FMO法によるタンパク質等の量子化学計算結果を公開している。
    FMO計算から得られる残基単位の定量的な相互作用エネルギーについて、
    web上での簡易解析および専用可視化プログラムBioStation Viewerを用いた詳細解析が可能。

    FMO database
    BioStation Viewer
    関連情報 FMO創薬コンソーシアム

     
  • シングルセルデータを生物機能の空間で解析するsoftware「ASURAT」
    ASURAT for analyzing single-cell data in the space of biological functions
    1細胞トランスクリプトームや空間トランスクリプトームを「生物機能の空間」で機能別に分類するツール。
    これまで以上に分類性能が高く、かつ説得力のある解釈を出力する。
    現在、ASURATの後継として、さらに強力な分類器を開発中。

    関連記事 大阪大学研究専用ポータルサイトResOU